Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAGR1Q9BTK6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAGR1Q9BTK6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms