Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms