Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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