Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALPK3Q96L96 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms