Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms