Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms