Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms