Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC41PQ6P2S7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC41PQ6P2S7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC41PQ6P2S7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms