Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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