Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225Q6GV28 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms