Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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