Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms