Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms