Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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