Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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