Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms