Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms