Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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