Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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