Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR4Q13639 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR4Q13639 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR4Q13639 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR4Q13639 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR4Q13639 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR4Q13639 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms