Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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