Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms