Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms