Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms