Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms