Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms