Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms