Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms