Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPL23P62829 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms