Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms