Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ERVPABLB-1P60509 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms