Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms