Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms