Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN3P54252 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms