Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms