Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ARRB1P49407 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARRB1P49407 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms