Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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