Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANGAP1P46060 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms