Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK1P39086 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms