Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms