Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms