Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms