Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CRABP1P29762 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms