Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms