Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms