Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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