Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT4P19013 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT4P19013 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRT4P19013 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRT4P19013 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRT4P19013 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms