Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAV1P15498 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms