Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms