Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms